許多手冊中都會載明無菌操作台中的HEPA濾網、初級濾網及UV燈管的更換時機，通常說明方式，舉例3000小時/更換HEPA濾網，500小時/更換初級濾網，6000小時/更換UV燈管等等。
但隨著不同的實驗室環境，不同的實驗內容，對HEPA高效率濾網的壽命影響都會有所不同，舉例來說，有些GMP藥廠的潔淨程度高，相對來說HEPA濾網的壽命及潔淨度會比一般校園實驗室的HEPA高效率濾網來的長，因此用實驗時數來判斷HEPA高效率濾網更換的時間，可能會和實際狀況有所出入。
所以除了用時數來判斷HEPA濾網更換時機外，還能用微粒子計數器(Particle Counters) 直接針對操作台內的操作空間，做潔淨度測試，透過潔淨度測試，可直接了解操作空間的潔淨狀況，進而瞭解HEPA高效率濾網的效能程度，更能貼近實際狀況，來判斷是否更換，充分發揮無菌操作台的潔淨效能。 備註:HEPA高效率濾網可以給予一個完善的潔淨空間，但實驗人員良好的操作習慣，更能提高整體的實驗品質，進而將實驗結果的環境因素降至最低。
